Atmospheric Toolbox¶

Στη συστοιχία "Αριστοτέλης" είναι εγκατεστημένα τα εργαλεία HARP 1.30 και CODA 2.25.6

Χρήση από τερματικό¶

Για να χρησιμοποιήσουμε το κεντρικά εγκατεστημένο περιβάλλον μπορούμε να τρέξουμε τις παρακάτω εντολές:

$ module load harp/1.30 coda/2.25.6
$ python
>> import harp
>> import coda

CODA definition path

Για να χρησιμοποιηθούν τα αρχεία .codadef που καθορίζουν το CODA Product Format Definition Description Format ορίζεται από το harp module file η μεταβλητή CODA_DEFINITION:

$ module load harp/1.30
$ echo $CODA_DEFINITION 
/mnt/apps/custom/harp/1.30/coda/definitions

Χρήση σε συνδυασμό με άλλα python packages¶

Εφόσον χρειάζεται να χρησιμοποιήσουμε τα Python εργαλεία του Atmospheric Toolbox μαζί με άλλα πακέτα, θα χρειαστεί να δημιουργήσουμε ένα νέο Python Virtual Environment, όπως στο παρακάτω παράδειγμα.

Χρήση εργαλείων Atmospheric Toolbox σε Virtual Environment

$ module load harp/1.30 coda/2.25.6
$ module load gcc/15.2.0 python/3.13.0
$ python -m venv ~/harp-1.30-env
$ source ~/harp-1.30-env/bin/activate
(harp-1.30-env) $ pip install --upgrade pip
(harp-1.30-env) $ pip install numpy cffi  # AT dependencies - must have
(harp-1.30-env) $ pip install ...  # Install additional packages
(harp-1.30-env) $ python 
>> # Test that AT packages are visible
>> import harp
>> import coda

Python Virtual Environments

Μπορείτε να βρείτε περισσότερες πληροφορίες για την δημιουργία, την χρήση, την εγκατάσταση πακέτων και την αποθήκευση του περιβάλλοντος στην ενότητα: Python Virtual Environment

Χρήση σε Spyder IDE¶

Για να χρησιμοποιήσουμε τα εργαλεία του Atmospheric Toolbox στον Spyder IDE, θα πρέπει ο Spyder IDE να εκκινήσει σε περιβάλλον όπου έχουν προηγουμένως φορτωθεί τα modules του Atmospheric Toolbox.

Προαπαιτούμενο

Πριν δοκιμάσουμε να χρησιμοποιήσουμε τα εργαλεία του Atmospheric Toolbox στον Spyder IDE, θα πρέπει να έχουμε φτιάξει ένα python Virtual Environment, όπως περιγράφεται παραπάνω. Το Virtual Environment είναι απαραίτητο να περιέχει τα πακέτα numpy, cffi και spyder-kernels σε πρόσφατες εκδόσεις.

Δημιουργούμε ένα νέο Aristotle Desktop Session
Ανοίγουμε το Terminal app.
Σε νέο terminal session, εκτελούμε τις παρακάτω εντολές για να εκκινήσουμε τον Spyder IDE.
```
$ module load harp/1.30 coda/2.25.6
$ module load spyder/latest
$ spyder
```
Ρυθμίζουμε ως Python Interpreter του Spyder IDE αυτόν που αντιστοιχεί στο Virtual Environment μας. Αυτή η ρύθμιση αρκεί να γίνει μία φορά.
Για να φορτώσουμε τα εργαλεία του Atmoshperic Toolbox είναι απαραίτητες οι παρακάτω εντολές. Για Python scripts, οι εντολές χρειάζεται να προστεθούν στην αρχή του script. Για την διαδραστική κονσόλα, χρειάζεται να εκτελούνται κάθε φορά που ανοίγουμε καινούργιο session.
```
import sys
sys.path.append("/mnt/apps/custom/harp/1.30/lib/python3.13/site-packages/")
sys.path.append("/mnt/apps/custom/coda/2.25.6/lib/python3.13/site-packages/")
```

Εκτέλεση σε login node

Οι ίδιες εντολές για την εκτέλεση του Spyder IDE μπορούν να εκτελεστούν και σε κάποιο από τα login nodes, εφόσον έχουμε ενεργοποιήσει το X Forwarding κατά την εκκίνηση του SSH session.