Περιγραφή¶
Multistrand, kinetic simulator for nucleic acid
Mutlistrand 2.1.3¶
Παράδειγμα χρήσης¶
Δημιουργούμε ένα νέο φάκελο όπου τοποθετούμε τα αρχεία εισόδου.
# mkdir multistrand-2.1.3-case
# cd multistrand-2.1.3-case
Το script που θα χρησιμοποιήσουμε για την υποβολή μίας εργασίας εμφανίζεται παρακάτω:
SLURM submission script
#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=multistrand-2.1.3-case
#SBATCH --partition=batch
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --time=1:00:00
module load gcc/8.2.0 python/2.7.15 NUPACK/3.2.2 multistrand/2.1.3
python code.py
Αποθηκεύουμε τα περιεχόμενα σε ένα νέο αρχείο (έστω multistrand-2.1.3-case.sh
) και το υποβάλλουμε προς εκτέλεση με την εντολή:
# sbatch multistrand-2.1.3-case.sh
Παρακολουθούμε με squeue
την εξέλιξη της εργασίας.
Eφόσον η εργασία έχει εκκινήσει μπορούμε να ελέγχουμε την πρόοδο της επίλυσης μέσω των αρχείων εξόδου. Π.χ.:
# tail -f *.out
τελευταία ενημέρωση:
August 21, 2019