Περιγραφή

The scientific Python Development Environment

spyder Homepage

Spyder 5.5.3

Παράδειγμα χρήσης

Για να χρησιμοποιήσουμε το γραφικό περιβάλλον του Spyder στην συστοιχία μπορούμε να επισκεφτούμε με έναν browser την σελίδα: https://hpc.auth.gr και να ξεκινήσουμε απομακρυσμένη επιφάνεια εργασίας στην συστοιχία σύμφωνα με τις οδηγίες.

1. Από το menu επιλέγουμε Applications -> Terminal Emulator και εκτελούμε τις παρακάτω εντολές:

# module load gcc/12.2.0 miniconda3
# source $CONDA_PROFILE/conda.sh
# conda activate /mnt/apps/custom/conda/spyder-env/5.5
# spyder

Με τις ίδιες εντολές θα μπορούσαμε να ξεκινήσουμε το Spyder και σε ένα login node της συστοιχίας, εφόσον έχουμε συνδεθεί με ssh με ενεργοποιημένο X Forwarding.

Spyder custom conda environment

Για να δημιουργήσουμε ένα custom conda environment που περιλαμβάνει το Spyder μπορούμε να χρησιμοποιήσουμε την παρακάτω ακολουθία εντολών:

# module load gcc miniconda3
# source $CONDA_PROFILE/conda.sh
# conda create -n spyder-env
# conda activate spyder-env
# conda install --yes -c conda-forge spyder numpy matplotlib
# spyder

Στο ίδιο environement μπορούμε να προσθέσουμε επιπλέον packages ή να κάνουμε clone το environment ώστε να τροποποιήσουμε ένα αντίγραφο. Για παράδειγμα:

Clone environment and add extra packages

# module load gcc miniconda3
# source $CONDA_PROFILE/conda.sh
# conda create --clone spyder-env -n harp-with-spyder
# conda activate harp-with-spyder
# conda install --yes -c conda-forge harp python=3.11.8
# spyder