Κεντρικά διαθέσιμο¶
Παρακάτω δίνεται το διαθέσιμο λογισμικό στην Ιδρυματική συστοιχία "Αριστοτέλης". Σημειώστε ότι κάθε λογισμικό ή εφαρμογή μπορεί να είναι εγκατεστημένο σε περισσότερες από μία εκδόσεις.
Αίτηση για εγκατάσταση λογισμικού
Εάν επιθυμείτε την εγκατάσταση κάποιου λογισμικού που δεν εμφανίζεται στις παρακάτω λίστες μπορείτε να συμπληρώσετε τη σχετική φόρμα.
Λίστες λογισμικών/εφαρμογών¶
Διαθέσιμο λογισμικό με gcc/9.4.0 και openmpi/4.1.2
bash: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/4.1.2-akxtzzl/gcc/9.4.0 ----
adios2/2.7.1-lqvuz6m netcdf-fortran/4.5.3-kwwjlsp
assimp/5.2.2-nntzku6 netlib-scalapack/2.1.0-5qmre47
assimp/5.2.2-3qqtw3g parallel-netcdf/1.12.2-7irbwdb
boost/1.70.0-6yznzkv parmetis/4.0.3-macymck
boost/1.78.0-rordfu6 (D) py-mpi4py/3.1.2-itenx6c
cdo/2.0.4-dfcwhiv py-mpi4py/3.1.2-wikh6ek (D)
conduit/develop-nikazi6 py-torch/1.10.2-23ifjdb
cp2k/9.1-52q4yar py-torch/1.12.0-htawitd (D)
fftw/3.3.10-flz2zp5 qt/5.15.3-c4wkd2x
fftw/3.3.10-lqtwa5m (D) qt/5.15.3-ghzxt4n
gromacs/2022-47qrtrj qt/5.15.3-s7i54vz
hdf5/1.8.22-gmraij7 quantum-espresso/7.0-xipd4nj
hdf5/1.12.1-ms3fk4c (D) silo/4.10.2-qhb7azh
hypre/2.24.0-z5wud3s valgrind/3.18.1-cv2y2b4
libfms/0.2.0-abjbutf vasp/6.2.1-rt4wjgz
libqglviewer/2.7.2-kjba2jh visit/3.2.2-b7zvail
libqglviewer/2.7.2-olrokq5 vtk/8.1.0-yfjq3oo
libqglviewer/2.7.2-4imyod2 (D) vtk/8.1.2-62stiqe
mfem/4.4.0-cmsyarw vtk/9.0.3-fdpi4ud
namd/2.14-sylaqlh vtk/9.0.3-is4nn5l
ncview/2.1.8-gor4hxx vtk/9.0.3-nptypxc
netcdf-c/4.8.1-opy7phc vtk/9.0.3-pvi77qr (D)
netcdf-c/4.8.1-r5ikqt6 (D) wannier90/3.1.0-ynl3yps
netcdf-cxx/4.2-f6vloq7 wrf/4.1.2-kfe23nz
netcdf-cxx/4.2-3345kjf (D)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/gcc/9.4.0 ----
alsa-lib/1.2.3.2-akz6p57
alsa-lib/1.2.3.2-nx4y4ju (D)
apr-util/1.6.1-m36nz6k
apr/1.7.0-syo5llo
assimp/5.2.2-ukw3inz
assimp/5.2.2-3sl3noj (D)
autoconf-archive/2019.01.06-chzmaxh
autoconf/2.69-hg7ntax
autoconf/2.69-w4kqf4w
autoconf/2.69 (D)
automake/1.16.5-cnmo5vl
automake/1.16.5-scauqwt
automake/1.16.5 (D)
bcftools/1.14-widdjr4
bdftopcf/1.0.5-auzkppj
bdftopcf/1.0.5-uf6dygg (D)
berkeley-db/18.1.40-izlwsbt
berkeley-db/18.1.40-oricu4h
berkeley-db/18.1.40-vno7asx (D)
binutils/2.38-ettviez
binutils/2.38-pru5rfs
binutils/2.40-axtdkv3 (D)
bison/3.8.2-vqnznmj
bison/3.8.2-yxidqmj (D)
boost/1.45.0-scxnuw6
boost/1.78.0-ep4drgo
boost/1.78.0-ijhdgnh
bzip2/1.0.8-tidfxji
bzip2/1.0.8-yhwapba
bzip2/1.0.8-7ojj7ny (D)
c-blosc/1.21.1-fbfuxkl
c-blosc/1.21.1-vvrugr4
c-blosc/1.21.1-x46qd33 (D)
cairo/1.16.0-fhcvvk7
cairo/1.16.0-gqzqpml
cairo/1.16.0-juzhzgl
cairo/1.16.0-mzi2wnc
cairo/1.16.0-ngzp3ko
cairo/1.16.0-4jcg5sh
cairo/1.16.0-5bcwufz (D)
charmpp/7.0.0-j3twjkc
charmpp/7.0.0-rtnv3km (D)
cmake/3.11.4-jqpkuop
cmake/3.14.7-rlxmiok
cmake/3.22.2-hfiqefy
cmake/3.22.3-wfqs5bb
cmake/3.22.3-7ojb66t (D)
cni-plugins/1.0.1-rpccsnl
conmon/2.0.30-cgllkxc
cpio/2.13-gljq75v
cuda/11.2.2-kkrwdua
cuda/11.6.1-kinwfbx (D)
cudnn/8.4.0.27-11.6-wue5q7h
curl/7.78.0-wyloedq
curl/7.81.0-c64fu3k
curl/7.81.0-efegibc
curl/7.85.0-jcbr2y5
curl/8.0.1-huhepb6 (D)
damageproto/1.2.1-k5r5odv
damageproto/1.2.1-3uewmu5 (D)
diffutils/3.8-pjmzdti
diffutils/3.8-xqhi77g (D)
double-conversion/3.1.5-cukz4kr
double-conversion/3.1.5-6xbct35 (D)
doxygen/1.9.3-6lxvbzo
dsfmt/2.2.5-osrc5yz
eigen/3.4.0-cpddole
eigen/3.4.0-6jzfdfk (D)
elfutils/0.189-7xi2swl
expat/2.4.6-n5hiyr5
expat/2.4.6-7kw6nng
expat/2.4.8-gsg4xph
expat/2.4.8
expat/2.4.8-65lfdzj (D)
fastqc/0.11.9-dwcm5pl
ffmpeg/4.4.1-eygejnb
ffmpeg/4.4.1-3xwpmc7 (D)
findutils/4.8.0-hwcyg33
findutils/4.8.0-xswm7bx (D)
fixesproto/5.0-b4nbggp
fixesproto/5.0-4mbge7o (D)
flex/2.6.1-g5wzogh
flex/2.6.1-judmwsd (D)
font-util/1.3.2-wca46ek
font-util/1.3.2-xlhpnab (D)
fontconfig/2.13.94-duz2vej
fontconfig/2.13.94-fnsadi6
fontconfig/2.13.94-l5lu3n3
fontconfig/2.13.94-x6ceniy (D)
fontsproto/2.1.3-r6kci2d
fontsproto/2.1.3-4t6tzv3 (D)
freeglut/3.2.2-galifnz
freeglut/3.2.2-po2wxvp
freeglut/3.2.2-roztq3n (D)
freetype/2.10.2-btrer4g
freetype/2.10.2-vzmdp5l
freetype/2.11.1-cnpjnyy
freetype/2.11.1-opzo5zp
freetype/2.11.1-qqlwuaa (D)
fribidi/1.0.5-pa6uhe2
fribidi/1.0.5-rex7hbp (D)
fxdiv/2020-04-17-zxvl4hf
gatk/4.3.0.0-udra45u
gawk/5.1.1-tqo5duk
gdal/3.4.2-vdni324
gdal/3.7.0-wxn6zqr (D)
gdb/11.1-goaoxyb
gdbm/1.19-ad4zlj2
gengetopt/2.23-wptb6xl
geos/3.9.1-fixb7qt
gettext/0.21-zx2ynzm
git/2.35.1-k3dhdis
git/2.38.1-i7p4ltz
git/2.38.1-jmpkos7 (D)
gl2ps/1.4.2-ixgwpl3
gl2ps/1.4.2-jttg6de
gl2ps/1.4.2-q4rpf6q (D)
glew/2.1.0-pet27ou
glew/2.1.0-jinhlgx
glew/2.1.0-4ez7rrx
glew/2.2.0-bpisnv5 (D)
glib/2.56.3-dxzqpv2
glib/2.70.4-fxuicfa
glib/2.70.4-mw2xuhu
glib/2.70.4-rse5rtu
glib/2.70.4-zegv3dn
glib/2.70.4-zrrgqcy (D)
glproto/1.4.17-rb2bvb3
glproto/1.4.17-tk72ej3 (D)
glx/1.4-qvcazzd
gmake/4.3-s7kp4ai
gmp/6.2.1-nusckoo
gmp/6.2.1-zjg6i7i (D)
gnupg/2.3.4-ssx77he
go-bootstrap/1.4-bootstrap-20171003-e46fygm
go-md2man/1.0.10-wrmwk5c
go/1.17.7-eguwhva
gobject-introspection/1.56.1-poor52t
googletest/1.10.0-gvowpwv
gperf/3.1-iqu7fs4
gperf/3.1-u4m3l2k (D)
gpgme/1.16.0-2yg3nyq
gsl/2.7-jbsfpks
gsl/2.7-lrmyzto (D)
gts/121130-5lzgheb
gzip/1.11-oyhhzns
harfbuzz/2.9.1-ar6hfzb
harfbuzz/2.9.1-z4ottln
harfbuzz/2.9.1-2utyrzy
harfbuzz/2.9.1-2wyrlhb
harfbuzz/2.9.1-5ekpmh7
harfbuzz/2.9.1-5rfc3py (D)
hdf5/1.8.22-rspwsqh
hisat2/2.2.0-xcmr3ln
htslib/1.14-u6uuwb3
htslib/1.14-26gpy7a
htslib/1.16-wtdlkdg (D)
hwloc/2.7.0-fww63cx (L)
hwloc/2.7.0-m2d6ypx
hwloc/2.7.0-zvfop7g
hwloc/2.8.0-iwwskzt (D)
icu4c/67.1-ukz4dc7
icu4c/67.1-yigx4i3 (D)
inputproto/2.3.2-mtjoqtv
inputproto/2.3.2-wuxynjx (D)
intel-mkl/2020.4.304-msmjmre
intel-mkl/2020.4.304-s3ubzrr (D)
intel-tbb/2020.3-ikbdlwe
jasper/2.0.32-uqv2yoe
json-c/0.15-mwwnwjy
jsoncpp/1.9.4-hwifjv6
jsoncpp/1.9.4-3fxlzla (D)
julia/1.7.2-ojl4pug
julia/1.9.0-dfidsna (D)
kbproto/1.0.7-n7qvtne
kbproto/1.0.7-3gloxb7 (D)
kim-api/2.2.1-omdtzc6
kim-api/2.2.1-4flee2k (D)
kineto/2021-05-12-winvmbj
kokkos/3.5.00-hi7w5og
kokkos/3.5.00-lfjx5an
kokkos/3.7.00-pkxaqw3 (D)
krb5/1.19.2-f5joegi
krb5/1.19.3-rrwanq6 (D)
lcms/2.9-bemrrlv
lcms/2.9-ntng7yx
lcms/2.9-xiyy25u (D)
libaec/1.0.5-c2kkll7
libaec/1.0.5-haaupup (D)
libassuan/2.5.5-n35yah4
libblastrampoline/3.1.0-xnpx53t
libblastrampoline/5.8.0-pfyk23e (D)
libbsd/0.11.5-dl7sk5s
libcap/2.25-dh3sktx
libdeflate/1.7-7tbjlqq
libdeflate/1.10-xwansi2 (D)
libdrm/2.4.110-x5e4rf3
libdrm/2.4.110-yksjfbn (D)
libedit/3.1-20210216-tm66a2y (L)
libedit/3.1-20210216-3pka2cj
libedit/3.1-20210216-zusnjxb (D)
libevent/2.1.12-s4jmjfb
libevent/2.1.12-yiylwp4 (L)
libevent/2.1.12-43larwe (D)
libfabric/1.14.0-2dv7run
libffi/3.4.2-7agi3xy
libfontenc/1.1.3-psfl4ln
libfontenc/1.1.3-274dqjw (D)
libgcrypt/1.9.4-rqshwyj
libgeotiff/1.6.0-niftbxq
libgeotiff/1.6.0-r57kce6 (D)
libgit2/1.1.1-rxej3jj
libgit2/1.5.0-vancgtc (D)
libgpg-error/1.43-zbpojos
libiconv/1.16-fnkrwyb
libidn2/2.3.0-e5xztlp
libidn2/2.3.0
libidn2/2.3.0-324bkf4 (D)
libint/2.6.0-mwuvgpk
libjpeg-turbo/2.1.0-e74gm3z
libjpeg-turbo/2.1.0-sj27vxn (D)
libksba/1.6.0-iumxke6
libmd/1.0.4-lvecmwp
libmd/1.0.4-x6nzeq2
libmd/1.0.4-ym3hc5l
libmd/1.0.4 (D)
libmng/2.0.3-ayjn2qz
libmng/2.0.3-enfrgsm
libmng/2.0.3-lzl3kja (D)
libnl/3.3.0-dijmesb (L)
libnl/3.3.0-kbwdfmc (D)
libogg/1.3.5-dqzlqde
libogg/1.3.5-zhqvuks (D)
libpciaccess/0.16-opzmjd5
libpng/1.6.37-pbzdufe
libpng/1.6.37-hu2cvjw
libpng/1.6.37-rxuhfqa
libpng/1.6.37-zkzjv46 (D)
libpthread-stubs/0.4-rhyivae
libpthread-stubs/0.4-vzgktmb (D)
libseccomp/2.5.3-3rrkkpr
libsigsegv/2.13-3yjosbx
libslirp/4.6.1-6joqzun
libssh2/1.10.0-evudeac
libssh2/1.10.0-ncwp2kh (D)
libtheora/1.1.1-felicyv
libtheora/1.1.1-qla6ufz (D)
libtiff/4.3.0-gzfuqnk
libtiff/4.3.0-2puwzfl (D)
libtirpc/1.2.6-dobp2cd
libtirpc/1.2.6-4kmf5ge (D)
libtool/2.4.6-khbtb4w
libtool/2.4.6-tnov4mx (D)
libunistring/0.9.10-rmhjt7k
libunistring/0.9.10-v4dc4js
libunistring/0.9.10 (D)
libunwind/1.6.2-fupx53n
libuv-julia/1.44.2-2de4rth
libuv/1.42.0-cejgspc
libwhich/1.1.0-mvs4fgc
libx11/1.7.0-bxqrecg
libx11/1.7.0-upmcenq
libx11/1.7.0-5h7mjzl (D)
libxau/1.0.8-kgvuiyi
libxau/1.0.8-pm4l5fi (D)
libxc/5.1.7-t3zz6m3
libxc/5.2.3-r3p7hwp (D)
libxcb/1.14-pgiqpui
libxcb/1.14-kavm37t
libxcb/1.14-zhe4wib (D)
libxdamage/1.1.4-bpmwogm
libxdamage/1.1.4-l3vxmuh (D)
libxfixes/5.0.2-k3bk3jq
libxfixes/5.0.2-xnojd2y (D)
libxfont/1.5.2-dvmprka
libxfont/1.5.2-75r6ag7 (D)
libxft/2.3.2-fgfbh3v
libxi/1.7.6-e5o4vxi
libxi/1.7.6-qbol4fc (D)
libxkbcommon/0.8.2-e62i2ru
libxkbcommon/0.8.2-zmpmt57 (D)
libxkbfile/1.0.9-c3fmnod
libxkbfile/1.0.9-wsxkpsj (D)
libxml2/2.9.12-pwkfd3c
libxml2/2.9.12-2h7tr2u
libxml2/2.9.12-76wsa25 (L)
libxml2/2.10.1-dh6ycxw (D)
libxrandr/1.5.0-bqssuin
libxrandr/1.5.0-f4fmhpq
libxrandr/1.5.0-tf3q4ke (D)
libxscrnsaver/1.2.2-3jl5jkj
libxsmm/1.17-wocpspa
libxt/1.1.5-gz66vav
libxt/1.1.5-tn6n6ia
libxt/1.1.5-3xympea (D)
libxxf86vm/1.1.4-byoq4mv
libxxf86vm/1.1.4-qofs7y6 (D)
libyaml/0.2.5-fbgaath
llvm/12.0.1-rnchnhs
llvm/12.0.1-sjkhhc7
llvm/12.0.1-yqulxrq
llvm/12.0.1-zbwlzui
llvm/12.0.1-56m7rpl
llvm/14.0.6-wco2r3j (D)
lz4/1.9.3-cylucy4
m4/1.4.19-pr4reya
m4/1.4.19
m4/1.4.19-3ecjovz (D)
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mbedtls/2.28.2-ke5cune (D)
mesa-glu/9.0.1-mxfmomw
mesa-glu/9.0.1-p2azm27
mesa-glu/9.0.1-5sa6rho (D)
mesa/21.3.1-ac7iby3
mesa/21.3.1-2dqsh63
mesa/21.3.1-4jwumcw
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mesa/22.1.2-pnsryct (D)
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miniconda3/4.10.3-zqgcgfl (D)
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mkfontdir/1.0.7-w27br6m (D)
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mkfontscale/1.1.2-qyc3x7f (D)
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mpfr/4.1.0-lauezru (D)
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openblas/0.3.20-njbcr2x
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pcre2/10.39 (D)
perl-data-dumper/2.173-heg26f5
perl-data-dumper/2.173-y5rntvw (D)
perl/5.34.0-euvqlmz
perl/5.34.0-35gj4jp
perl/5.34.0-zk3danl
perl/5.36.0-loec2t6
perl/5.36.0-wcwt74e
perl/5.36.0 (D)
pigz/2.7-ligokwt
pigz/2.7-qnn42uc
pigz/2.7 (D)
pinentry/1.2.0-hty3qd7
pixman/0.40.0-immznt4
pixman/0.40.0-klkibuf (D)
pkgconf/1.8.0-fctmqyt
pkgconf/1.8.0-hph4dlc
pkgconf/1.8.0-kd5hllg (D)
pmix/4.1.2-72bitp3
popt/1.16-l3wbudb
postgresql/14.0-etfo3un
proj/7.2.1-s57juxj
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psimd/2020-05-17-7zy7whv
pthreadpool/2021-04-13-bttit6x
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py-alabaster/0.7.12-szb6seq
py-appdirs/1.4.4-pi4rq7i
py-asttokens/2.0.5-h2pmo2x
py-attrs/22.1.0-hvyti4g
py-babel/2.9.1-pzweez6
py-backcall/0.2.0-unnpsnk
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Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
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STAR-CCM/14.06.013 panoply/4.11.1
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ansys/2019R3 (D)
------------------------- /mnt/apps/custom/modulefiles -------------------------
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Garfield++/4.0 ioapi/3.2-20200828
MESA/r15140 (D) jblas/v1.2.4
NUPACK/4.0.0.23 (D) lammps/23jun2022-allegro-rome
OpenCilk/v2.0 lammps/20200505-gcc-vtk
ProDiMo/devel lammps/20200505-intel
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2 lammps/20220107-gcc-nequip
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2.3.3 lammps/20220517-gcc-nequip
ambertools/22 lammps/20220623-ampere (D)
castep/19.11 libradtran/2.0.4
castep/20.11 (D) lositan/4ed774c
centos8 morphographx/2.0
crystal17/v1.0.2 openblas/v0.3.24
ecaccess-webtoolkit/6.3.1 oq-engine/3.13.0
einstein-toolkit/Kowalevski platanus/v1.2.4
gffcompare/ebef7e0 xflr5/6.56
-------------------- /usr/share/lmod/lmod/modulefiles/Core ---------------------
lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Διαθέσιμο λογισμικό με gcc/9.2.0 και openmpi/3.1.4
bash: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/3.1.4-bzxo26r/gcc/9.2.0 ----
cdo/1.9.7.1 hdf5/1.10.5 plumed/2.5.0
cp2k/7.1 ncview/2.1.7 r-ncdf4/1.16.1
fftw/3.3.8 netcdf/4.7.2 scotch/6.0.6
gromacs/2018.1 netlib-scalapack/2.0.2
gromacs/2019.2 (D) openfoam/1906
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/gcc/9.2.0 ----
alsa-lib/1.2.2
alsa-lib/1.2.3.2 (D)
apr-util/1.6.1
apr/1.7.0
autoconf-archive/2019.01.06
autoconf/2.69
automake/1.16.1
automake/1.16.2 (D)
bcftools/1.10.2
bdftopcf/1.0.5
bdw-gc/8.0.0
berkeley-db/18.1.40-ofgrkls
berkeley-db/18.1.40
berkeley-db/18.1.40-65ijive (D)
bison/3.4.2
bison/3.6.4 (D)
blast-plus/2.9.0
blat/35
boost/1.68.0
boost/1.70.0
boost/1.74.0 (D)
bowtie2/2.4.1-py-377
bowtie2/2.4.1 (D)
bzip2/1.0.8-twxxp2k
bzip2/1.0.8 (D)
c-blosc/1.17.0
cairo/1.16.0-py-3.8.6-d545n4n
cairo/1.16.0-py-377
cairo/1.16.0 (D)
cgal/4.13
cgal/5.0.3 (D)
clhep/2.4.1.3
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MESA/r15140 (D) jblas/v1.2.4
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castep/19.11 libradtran/2.0.4
castep/20.11 (D) lositan/4ed774c
centos8 morphographx/2.0
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ecaccess-webtoolkit/6.3.1 oq-engine/3.13.0
einstein-toolkit/Kowalevski platanus/v1.2.4
gffcompare/ebef7e0 xflr5/6.56
-------------------- /usr/share/lmod/lmod/modulefiles/Core ---------------------
lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Διαθέσιμο λογισμικό με gcc/8.2.0 και openmpi/3.1.4
bash: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/3.1.4-nhgwvph/gcc/8.2.0 ----
hdf5/1.8.19 netcdf-cxx/4.2 raxml/8.2.11 valgrind/3.15.0
hdf5/1.10.5 (D) netcdf/4.7.2 (D) scalasca/2.5
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/gcc/8.2.0 ----
apr-util/1.6.0
apr/1.6.2
at-spi2-atk/2.26.2
at-spi2-core/2.28.0
atk/2.30.0
autoconf/2.69-c3cfkq6
autoconf/2.69 (D)
automake/1.16.1
automake/1.16.2
automake/1.16.5-t6kvnrm (D)
bcftools/1.9
bdftopcf/1.0.5
beast1/1.10.0-py-27
beast1/1.10.4-py-27 (D)
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berkeley-db/18.1.40 (D)
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PatternCNV/1.0 orca/5.0.3-openmpi-4.1.1
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castep/20.11 (D) lositan/4ed774c
centos8 morphographx/2.0
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ecaccess-webtoolkit/6.3.1 oq-engine/3.13.0
einstein-toolkit/Kowalevski platanus/v1.2.4
gffcompare/ebef7e0 xflr5/6.56
-------------------- /usr/share/lmod/lmod/modulefiles/Core ---------------------
lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Διαθέσιμο λογισμικό με gcc/7.3.0 και openmpi/3.1.4
bash: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/3.1.4-hjll44w/gcc/7.3.0 ----
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hdf5/1.10.5 (D) netlib-scalapack/2.0.2
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automake/1.16.2 (D) lz4/1.8.1.2
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bowtie2/2.3.4.1-py-27 mkfontscale/1.1.2
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bzip2/1.0.8 (D) nasm/2.13.03
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cmake/3.18.4 (D) numactl/2.0.11
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diffutils/3.7 (D) openssl/1.1.1d
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glproto/1.4.17 py-docutils/0.15.2
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help2man/1.47.11 (D) r/3.5.1-py-27
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hwloc/1.11.9 readline/7.0
hwloc/1.11.11 (D) readline/8.0 (D)
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icu4c/64.1 (D) samtools/1.9
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iozone/3_465 singularity/3.4.1
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jsoncpp/1.9.1 (D) sqlite/3.23.1
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libedit/3.1-20170329 squashfs/4.4 (D)
libedit/3.1-20191231 (D) sra-toolkit/2.9.2
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libgpg-error/1.36 tar/1.32
libgpg-error/1.37 (D) tcl/8.6.8
libharu/2.3.0 tcsh/6.18.01
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libjpeg-turbo/2.0.3 (D) tk/8.6.8
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libpng/1.6.37 (D) xcb-proto/1.13
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libxml2/2.9.8 xsd/4.0.0
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libxml2/2.9.10 (D) xz/5.2.4
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gcc/8.2.0 (D) intel/20.0.2
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gcc/12.2.0-fhg4pj2 nvhpc/23.5-hfce5ma
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AnsysEM/2019R1 ansys/2021R1
AnsysEM/2021R1 ansys/2022R1
AnsysEM/2023R1 ansys/2022R2
AnsysEM/2023R2 (D) ansys/2023R2
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CASA/5.6.0-60 cma/2023R2
CESM/v2.1.4 coda/2.21.1
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CONVERGE-IntelMPI/mpi/3.0.24 (D) fds/6.7.5 (D)
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CONVERGE-IntelMPI/udf/3.0.24 (D) gurobi/10.00
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CONVERGE-IntelMPI/utilities/3.0.24 (D) gurobi/10.0.1 (D)
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CONVERGE/2.4.23 idl/8.7.3
CONVERGE/3.0.5 (D) idl/8.8
Chaste/2017.1 iqtree/1.6.11
Ferret/7.5.0 lammps/20200505-gcc-vtk
GAMS/27.3.0 lammps/20200505-intel
GEMMA/0.98.1 matlab/R2012b
LDBlockShow/90679e1 matlab/R2018b
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Mathematica/12.0.0 matlab/R2021a
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NBO/7.0 metashape/2.0.1
NUPACK/3.2.2 modeltest/0.1.5
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lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Διαθέσιμο λογισμικό με gcc/7.3.0 και openmpi/3.1.3
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/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/3.1.3-f7vp4xh/gcc/7.3.0 ----
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curl/7.72.0 (D) openssh/8.4p1
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diffutils/3.7 (D) openssl/1.1.1d
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go/1.13.1 py-markupsafe/1.1.1 (D)
go/1.15.2 (D) py-numpy/1.15.2-py-27
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gperftools/2.7 py-setuptools/50.3.2 (D)
gsl/2.5 py-virtualenv/16.0.0-py-27
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harfbuzz/2.3.1 (D) python/3.7.4
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hdf5/1.10.4 qt/4.8.7
help2man/1.47.4 qt/5.13.1 (D)
help2man/1.47.11 (D) r/3.5.1-py-27
htslib/1.9 rdma-core/32.0
hwloc/1.11.9 readline/7.0
hwloc/1.11.11 (D) readline/8.0 (D)
icu4c/60.1 renderproto/0.11.1
icu4c/64.1 (D) samtools/1.9
inputproto/2.3.2 shadow/4.7
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iozone/3_465 singularity/3.4.1
jdk/11.0.2_9 singularity/3.6.4 (D)
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jsoncpp/1.7.3 sparsehash/2.0.3
jsoncpp/1.9.1 (D) sqlite/3.23.1
kbproto/1.0.7 sqlite/3.30.1
lcms/2.9 sqlite/3.33.0 (D)
libaio/0.3.110 squashfs/4.3
libedit/3.1-20170329 squashfs/4.4 (D)
libedit/3.1-20191231 (D) sra-toolkit/2.9.2
libfontenc/1.1.3 swig/4.0.0
libgpg-error/1.36 tar/1.32
libgpg-error/1.37 (D) tcl/8.6.8
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libjpeg-turbo/2.0.3 (D) tk/8.6.8
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gcc/12.2.0-fhg4pj2 nvhpc/23.5-hfce5ma
gcc/12.2.0 nvhpc/23.7-nklvvng
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AnsysEM/2019R1 ansys/2021R1
AnsysEM/2021R1 ansys/2022R1
AnsysEM/2023R1 ansys/2022R2
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Bismark/v0.24.2 bayescan/2.1
CASA/5.6.0-60 cma/2023R2
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CONVERGE-IntelMPI/mpi/3.0.24 (D) fds/6.7.5 (D)
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CONVERGE-IntelMPI/utilities/3.0.24 (D) gurobi/10.0.1 (D)
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CONVERGE/3.0.5 (D) idl/8.8
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Ferret/7.5.0 lammps/20200505-gcc-vtk
GAMS/27.3.0 lammps/20200505-intel
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LDBlockShow/90679e1 matlab/R2018b
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PatternCNV/1.0 orca/5.0.3-openmpi-4.1.1
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NUPACK/4.0.0.23 (D) lammps/23jun2022-allegro-rome
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STEMsalabim/5.0.0-mvapich2 lammps/20220107-gcc-nequip
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2.3.3 lammps/20220517-gcc-nequip
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castep/20.11 (D) lositan/4ed774c
centos8 morphographx/2.0
crystal17/v1.0.2 openblas/v0.3.24
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gffcompare/ebef7e0 xflr5/6.56
-------------------- /usr/share/lmod/lmod/modulefiles/Core ---------------------
lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Διαθέσιμο λογισμικό με gcc/6.4.0 και openmpi/3.1.3
Διαθέσιμο λογισμικό με intel/19.0.5 και intel-mpi/2019.4.243
bash: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/intel/19.0.5 ----
alsa-lib/1.2.2 lzma/4.32.7
alsa-lib/1.2.3.2 (D) m4/1.4.18
autoconf/2.69 meson/0.54.3
automake/1.16.1 meson/0.56.0 (D)
automake/1.16.2 (D) miniconda2/4.5.11
axel/2.16.1 miniconda3/4.5.11
berkeley-db/18.1.40 mpfr/4.0.2
bison/3.4.2 nasm/2.13.03
bison/3.6.4 (D) nasm/2.14.02
boost/1.70.0 nasm/2.15.05 (D)
bzip2/1.0.8 ncdu/1.13
cgal/4.13 ncurses/6.1
cmake/3.9.6 ncurses/6.2 (D)
cmake/3.12.3 netlib-lapack/3.8.0
cmake/3.15.4 ninja/1.10.0
cmake/3.17.3 ninja/1.10.1 (D)
cmake/3.18.4 (D) numactl/2.0.11
cpio/2.13 numactl/2.0.12
curl/7.63.0 numactl/2.0.14 (D)
curl/7.68.0 (D) openblas/0.3.7 (D)
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diffutils/3.7 (D) openmpi/3.1.2
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eigen/3.3.8 openmpi/3.1.4
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expat/2.2.10 (D) openssl/1.0.2o
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findutils/4.6.0 openssl/1.1.1g
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hwloc/1.11.9 pkgconf/1.7.3 (D)
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libxml2/2.9.10 (D) xz/5.2.5 (D)
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----- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/Core ------
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------------------------ /mnt/apps/prebuilt/modulefiles ------------------------
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AnsysEM/2019R1 ansys/2021R1
AnsysEM/2021R1 ansys/2022R1
AnsysEM/2023R1 ansys/2022R2
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CASA/5.6.0-60 cma/2023R2
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CONVERGE/3.0.5 (D) idl/8.8
Chaste/2017.1 iqtree/1.6.11
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GAMS/27.3.0 lammps/20200505-intel
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LDBlockShow/90679e1 matlab/R2018b
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OpenSees/3.1.0 openEMS/0.0.35
PartitionFinder/2.1.1 orca/4.2.1-openmpi-3.1.4
PatternCNV/1.0 orca/5.0.3-openmpi-4.1.1
R/3.6.3-intel orca/5.0.4-openmpi-4.1.1
REACTA/0.9.7 orca/5.0.4-openmpi-4.1.4 (D)
STAR-CCM/13.04.011 ovito/2.9.0
STAR-CCM/14.06.013 panoply/4.11.1
STAR-CCM/15.02.009 panoply/4.11.4
STAR-CCM/17.02.008-R8 (D) panoply/4.12.12
STAR-CD/4.28.033 panoply/5.2.3 (D)
STAR-CD/4.30.029 (D) plink/v1.9
STEMSim/R643 pycharm/2021.1.3
STEMsalabim/5.0.0 raxml-ng/0.9.0
STEMsalabim/5.3.0 (D) rstudio/1.4.1106
STRUCTURE/v2.3.4 rstudio/2022.07.2-576
WPS/4.1-intel rstudio/2023.06.2-561 (D)
WPS/4.1.2-intel (D) sambada/0.8.1
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WRF/4.1.2-intel (D) sixplore/2023R2
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ansys/2019R3 (D)
------------------------- /mnt/apps/custom/modulefiles -------------------------
DL_MESO/2019 intel/2021.5.0-12.2.0
Garfield++/4.0 ioapi/3.2-20200828
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STEMsalabim/5.0.0-mvapich2 lammps/20220107-gcc-nequip
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2.3.3 lammps/20220517-gcc-nequip
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-------------------- /usr/share/lmod/lmod/modulefiles/Core ---------------------
lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Διαθέσιμο λογισμικό με intel/19.0.5 και openmpi/3.1.4
bash: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/3.1.4-c7taqae/intel/19.0.5.281 ----
netlib-scalapack/2.0.2
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/intel/19.0.5 ----
alsa-lib/1.2.2 lzma/4.32.7
alsa-lib/1.2.3.2 (D) m4/1.4.18
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curl/7.68.0 (D) openblas/0.3.7 (D)
diffutils/3.6 openjdk/11.0.2
diffutils/3.7 (D) openmpi/3.1.2
double-conversion/2.0.1 openmpi/3.1.3
eigen/3.3.8 openmpi/3.1.4 (L)
expat/2.2.9 openmpi/3.1.6 (D)
expat/2.2.10 (D) openssl/1.0.2o
ffmpeg/4.2.2 openssl/1.1.1d
findutils/4.6.0 openssl/1.1.1g
flex/2.6.1 openssl/1.1.1h (D)
fontsproto/2.1.3 pcre/8.44
glib/2.64.3 pcre2/10.35
glproto/1.4.17 perl-data-dumper/2.173
gmake/4.2.1 perl/5.26.2
gmp/6.1.2 perl/5.30.0
gperf/3.1 perl/5.30.3
gsl/2.5 perl/5.32.0 (D)
help2man/1.47.11 pkgconf/1.4.2
hwloc/1.9 pkgconf/1.6.3
hwloc/1.11.9 pkgconf/1.7.3 (D)
hwloc/1.11.11 (D) popt/1.16
icu4c/65.1 py-mako/1.0.4
inputproto/2.3.2 py-markupsafe/1.1.1
intel-mkl/2020.1.217 py-setuptools/46.1.3
intel-mkl/2020.3.279 (D) py-setuptools/50.3.2 (D)
intel-mpi/2019.4.243 python/3.3.5
intel-mpi/2019.8.254 (D) python/3.7.7
jasper/1.900.1 python/3.8.6 (D)
jsoncpp/1.9.2 randrproto/1.5.0
kbproto/1.0.7 readline/7.0
kokkos/3.1.01 readline/8.0 (D)
kokkos/3.2.00 (D) renderproto/0.11.1
libedit/3.1-20191231 slurm/17-11-8-1
libfontenc/1.1.3 sqlite/3.30.1
libint/2.6.0 sqlite/3.31.1
libjpeg-turbo/1.5.90 sqlite/3.33.0 (D)
libjpeg-turbo/2.0.4 (D) tar/1.32
libpng/1.6.34 tcl/8.6.8
libpng/1.6.37 (D) texinfo/6.5
libpthread-stubs/0.4 voropp/0.4.6
libtool/2.4.6 xcb-proto/1.13
libx11/1.6.7 xextproto/7.3.0
libxau/1.0.8 xproto/7.0.31
libxc/4.3.4 xrandr/1.5.0
libxml2/2.9.8 xtrans/1.3.5
libxml2/2.9.9 xz/5.2.4
libxml2/2.9.10 (D) xz/5.2.5 (D)
libxrandr/1.5.0 yasm/1.3.0
libxt/1.1.5 zlib/1.2.11
lz4/1.9.2 zstd/1.4.5
----- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/Core ------
gcc/7.3.0 intel/19.0.5 (L,D)
gcc/8.2.0 (D) intel/20.0.2
gcc/9.2.0 nvhpc/22.2-d726g5z
gcc/9.4.0-eewq4j6 nvhpc/22.2-45ljrgv
gcc/10.2.0 nvhpc/23.3-4h7iw7d
gcc/12.2.0-fhg4pj2 nvhpc/23.5-hfce5ma
gcc/12.2.0 nvhpc/23.7-nklvvng
intel-oneapi-compilers/2022.0.2-sygdcrc nvhpc/23.7-oeip3tc (D)
------------------------ /mnt/apps/prebuilt/modulefiles ------------------------
ASReml/4.1.0 ansys/2020R2
AnsysEM/2019R1 ansys/2021R1
AnsysEM/2021R1 ansys/2022R1
AnsysEM/2023R1 ansys/2022R2
AnsysEM/2023R2 (D) ansys/2023R2
Bismark/v0.24.2 bayescan/2.1
CASA/5.6.0-60 cma/2023R2
CESM/v2.1.4 coda/2.21.1
CONVERGE-IntelMPI/3.0.24 coda/2.22.2 (D)
CONVERGE-IntelMPI/3.0.8 cst/2023
CONVERGE-IntelMPI/cvg/3.0.8 ecadxplore/2023R2
CONVERGE-IntelMPI/cvg/3.0.24 (D) examl/3.0.21
CONVERGE-IntelMPI/mpi/3.0.8 fds/6.7.5-intel
CONVERGE-IntelMPI/mpi/3.0.24 (D) fds/6.7.5 (D)
CONVERGE-IntelMPI/udf/3.0.8 gaussian/16_c02_avx2
CONVERGE-IntelMPI/udf/3.0.24 (D) gurobi/10.0.0
CONVERGE-IntelMPI/utilities/3.0.8 gurobi/10.00
CONVERGE-IntelMPI/utilities/3.0.24 (D) gurobi/10.0.1 (D)
CONVERGE-OMPI/3.0.8 harp/1.10
CONVERGE-OMPI/cvg/3.0.8 harp/1.14
CONVERGE-OMPI/mpi/3.0.8 harp/1.17
CONVERGE-OMPI/udf/3.0.8 harp/1.20.0 (D)
CONVERGE-OMPI/utilities/3.0.8 idl/8.4 (D)
CONVERGE/2.4.23 idl/8.7.3
CONVERGE/3.0.5 (D) idl/8.8
Chaste/2017.1 iqtree/1.6.11
Ferret/7.5.0 lammps/20200505-gcc-vtk
GAMS/27.3.0 lammps/20200505-intel
GEMMA/0.98.1 matlab/R2012b
LDBlockShow/90679e1 matlab/R2018b
MESA/r1039 matlab/R2020b
Mathematica/12.0.0 matlab/R2021a
MrBayes/3.2.7a matlab/R2022b (D)
NBO/7.0 metashape/2.0.1
NUPACK/3.2.2 modeltest/0.1.5
OpenCilk/9.0.1 (D) multistrand/2.1.3
OpenSees/3.0.2 (D) openCARP/0f7d8000
OpenSees/3.1.0 openEMS/0.0.35
PartitionFinder/2.1.1 orca/4.2.1-openmpi-3.1.4
PatternCNV/1.0 orca/5.0.3-openmpi-4.1.1
R/3.6.3-intel orca/5.0.4-openmpi-4.1.1
REACTA/0.9.7 orca/5.0.4-openmpi-4.1.4 (D)
STAR-CCM/13.04.011 ovito/2.9.0
STAR-CCM/14.06.013 panoply/4.11.1
STAR-CCM/15.02.009 panoply/4.11.4
STAR-CCM/17.02.008-R8 (D) panoply/4.12.12
STAR-CD/4.28.033 panoply/5.2.3 (D)
STAR-CD/4.30.029 (D) plink/v1.9
STEMSim/R643 pycharm/2021.1.3
STEMsalabim/5.0.0 raxml-ng/0.9.0
STEMsalabim/5.3.0 (D) rstudio/1.4.1106
STRUCTURE/v2.3.4 rstudio/2022.07.2-576
WPS/4.1-intel rstudio/2023.06.2-561 (D)
WPS/4.1.2-intel (D) sambada/0.8.1
WRF/4.1.2-intel-avx siwave/2023R2
WRF/4.1.2-intel (D) sixplore/2023R2
abaqus/2022 subread/2.0.3
admixture/1.3.0 sutility/2023R2
amber/18 thermo_pw/1.1.1
ansa/v19.1.1 turbomole/7.5
ansa/v19.1.2 turbomole/7.6
ansa/v21.0.0 turbomole/7.7 (D)
ansa/v22.1.2 vmd/1.9.4
ansa/v23.1.0 xcrysden/1.6.2
ansa/v24.0.1 (D) ximmer/9d165ea
ansys/2019R1 xtb/6.3.3
ansys/2019R3 (D)
------------------------- /mnt/apps/custom/modulefiles -------------------------
DL_MESO/2019 intel/2021.5.0-12.2.0
Garfield++/4.0 ioapi/3.2-20200828
MESA/r15140 (D) jblas/v1.2.4
NUPACK/4.0.0.23 (D) lammps/23jun2022-allegro-rome
OpenCilk/v2.0 lammps/20200505-gcc-vtk
ProDiMo/devel lammps/20200505-intel
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2 lammps/20220107-gcc-nequip
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2.3.3 lammps/20220517-gcc-nequip
ambertools/22 lammps/20220623-ampere (D)
castep/19.11 libradtran/2.0.4
castep/20.11 (D) lositan/4ed774c
centos8 morphographx/2.0
crystal17/v1.0.2 openblas/v0.3.24
ecaccess-webtoolkit/6.3.1 oq-engine/3.13.0
einstein-toolkit/Kowalevski platanus/v1.2.4
gffcompare/ebef7e0 xflr5/6.56
-------------------- /usr/share/lmod/lmod/modulefiles/Core ---------------------
lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Διαθέσιμο λογισμικό με intel/19.0.5 και openmpi/3.1.3
bash: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
/bin/sh: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (C.UTF-8)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/3.1.3-q4h4qu4/intel/19.0.5.281 ----
hdf5/1.8.19 netcdf-fortran/4.4.4 regcm/4.4.5.11
hdf5/1.10.4 (D) netcdf/4.6.1 regcm/4.7.0 (D)
---- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/intel/19.0.5 ----
alsa-lib/1.2.2 lzma/4.32.7
alsa-lib/1.2.3.2 (D) m4/1.4.18
autoconf/2.69 meson/0.54.3
automake/1.16.1 meson/0.56.0 (D)
automake/1.16.2 (D) miniconda2/4.5.11
axel/2.16.1 miniconda3/4.5.11
berkeley-db/18.1.40 mpfr/4.0.2
bison/3.4.2 nasm/2.13.03
bison/3.6.4 (D) nasm/2.14.02
boost/1.70.0 nasm/2.15.05 (D)
bzip2/1.0.8 ncdu/1.13
cgal/4.13 ncurses/6.1
cmake/3.9.6 ncurses/6.2 (D)
cmake/3.12.3 netlib-lapack/3.8.0
cmake/3.15.4 ninja/1.10.0
cmake/3.17.3 ninja/1.10.1 (D)
cmake/3.18.4 (D) numactl/2.0.11
cpio/2.13 numactl/2.0.12
curl/7.63.0 numactl/2.0.14 (D)
curl/7.68.0 (D) openblas/0.3.7 (D)
diffutils/3.6 openjdk/11.0.2
diffutils/3.7 (D) openmpi/3.1.2
double-conversion/2.0.1 openmpi/3.1.3 (L)
eigen/3.3.8 openmpi/3.1.4
expat/2.2.9 openmpi/3.1.6 (D)
expat/2.2.10 (D) openssl/1.0.2o
ffmpeg/4.2.2 openssl/1.1.1d
findutils/4.6.0 openssl/1.1.1g
flex/2.6.1 openssl/1.1.1h (D)
fontsproto/2.1.3 pcre/8.44
glib/2.64.3 pcre2/10.35
glproto/1.4.17 perl-data-dumper/2.173
gmake/4.2.1 perl/5.26.2
gmp/6.1.2 perl/5.30.0
gperf/3.1 perl/5.30.3
gsl/2.5 perl/5.32.0 (D)
help2man/1.47.11 pkgconf/1.4.2
hwloc/1.9 pkgconf/1.6.3
hwloc/1.11.9 pkgconf/1.7.3 (D)
hwloc/1.11.11 (D) popt/1.16
icu4c/65.1 py-mako/1.0.4
inputproto/2.3.2 py-markupsafe/1.1.1
intel-mkl/2020.1.217 py-setuptools/46.1.3
intel-mkl/2020.3.279 (D) py-setuptools/50.3.2 (D)
intel-mpi/2019.4.243 python/3.3.5
intel-mpi/2019.8.254 (D) python/3.7.7
jasper/1.900.1 python/3.8.6 (D)
jsoncpp/1.9.2 randrproto/1.5.0
kbproto/1.0.7 readline/7.0
kokkos/3.1.01 readline/8.0 (D)
kokkos/3.2.00 (D) renderproto/0.11.1
libedit/3.1-20191231 slurm/17-11-8-1
libfontenc/1.1.3 sqlite/3.30.1
libint/2.6.0 sqlite/3.31.1
libjpeg-turbo/1.5.90 sqlite/3.33.0 (D)
libjpeg-turbo/2.0.4 (D) tar/1.32
libpng/1.6.34 tcl/8.6.8
libpng/1.6.37 (D) texinfo/6.5
libpthread-stubs/0.4 voropp/0.4.6
libtool/2.4.6 xcb-proto/1.13
libx11/1.6.7 xextproto/7.3.0
libxau/1.0.8 xproto/7.0.31
libxc/4.3.4 xrandr/1.5.0
libxml2/2.9.8 xtrans/1.3.5
libxml2/2.9.9 xz/5.2.4
libxml2/2.9.10 (D) xz/5.2.5 (D)
libxrandr/1.5.0 yasm/1.3.0
libxt/1.1.5 zlib/1.2.11
lz4/1.9.2 zstd/1.4.5
----- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/Core ------
gcc/7.3.0 intel/19.0.5 (L,D)
gcc/8.2.0 (D) intel/20.0.2
gcc/9.2.0 nvhpc/22.2-d726g5z
gcc/9.4.0-eewq4j6 nvhpc/22.2-45ljrgv
gcc/10.2.0 nvhpc/23.3-4h7iw7d
gcc/12.2.0-fhg4pj2 nvhpc/23.5-hfce5ma
gcc/12.2.0 nvhpc/23.7-nklvvng
intel-oneapi-compilers/2022.0.2-sygdcrc nvhpc/23.7-oeip3tc (D)
------------------------ /mnt/apps/prebuilt/modulefiles ------------------------
ASReml/4.1.0 ansys/2020R2
AnsysEM/2019R1 ansys/2021R1
AnsysEM/2021R1 ansys/2022R1
AnsysEM/2023R1 ansys/2022R2
AnsysEM/2023R2 (D) ansys/2023R2
Bismark/v0.24.2 bayescan/2.1
CASA/5.6.0-60 cma/2023R2
CESM/v2.1.4 coda/2.21.1
CONVERGE-IntelMPI/3.0.24 coda/2.22.2 (D)
CONVERGE-IntelMPI/3.0.8 cst/2023
CONVERGE-IntelMPI/cvg/3.0.8 ecadxplore/2023R2
CONVERGE-IntelMPI/cvg/3.0.24 (D) examl/3.0.21
CONVERGE-IntelMPI/mpi/3.0.8 fds/6.7.5-intel
CONVERGE-IntelMPI/mpi/3.0.24 (D) fds/6.7.5 (D)
CONVERGE-IntelMPI/udf/3.0.8 gaussian/16_c02_avx2
CONVERGE-IntelMPI/udf/3.0.24 (D) gurobi/10.00
CONVERGE-IntelMPI/utilities/3.0.8 gurobi/10.0.0
CONVERGE-IntelMPI/utilities/3.0.24 (D) gurobi/10.0.1 (D)
CONVERGE-OMPI/3.0.8 harp/1.10
CONVERGE-OMPI/cvg/3.0.8 harp/1.14
CONVERGE-OMPI/mpi/3.0.8 harp/1.17
CONVERGE-OMPI/udf/3.0.8 harp/1.20.0 (D)
CONVERGE-OMPI/utilities/3.0.8 idl/8.4 (D)
CONVERGE/2.4.23 idl/8.7.3
CONVERGE/3.0.5 (D) idl/8.8
Chaste/2017.1 iqtree/1.6.11
Ferret/7.5.0 lammps/20200505-gcc-vtk
GAMS/27.3.0 lammps/20200505-intel
GEMMA/0.98.1 matlab/R2012b
LDBlockShow/90679e1 matlab/R2018b
MESA/r1039 matlab/R2020b
Mathematica/12.0.0 matlab/R2021a
MrBayes/3.2.7a matlab/R2022b (D)
NBO/7.0 metashape/2.0.1
NUPACK/3.2.2 modeltest/0.1.5
OpenCilk/9.0.1 (D) multistrand/2.1.3
OpenSees/3.0.2 (D) openCARP/0f7d8000
OpenSees/3.1.0 openEMS/0.0.35
PartitionFinder/2.1.1 orca/4.2.1-openmpi-3.1.4
PatternCNV/1.0 orca/5.0.3-openmpi-4.1.1
R/3.6.3-intel orca/5.0.4-openmpi-4.1.1
REACTA/0.9.7 orca/5.0.4-openmpi-4.1.4 (D)
STAR-CCM/13.04.011 ovito/2.9.0
STAR-CCM/14.06.013 panoply/4.11.1
STAR-CCM/15.02.009 panoply/4.11.4
STAR-CCM/17.02.008-R8 (D) panoply/4.12.12
STAR-CD/4.28.033 panoply/5.2.3 (D)
STAR-CD/4.30.029 (D) plink/v1.9
STEMSim/R643 pycharm/2021.1.3
STEMsalabim/5.0.0 raxml-ng/0.9.0
STEMsalabim/5.3.0 (D) rstudio/1.4.1106
STRUCTURE/v2.3.4 rstudio/2022.07.2-576
WPS/4.1-intel rstudio/2023.06.2-561 (D)
WPS/4.1.2-intel (D) sambada/0.8.1
WRF/4.1.2-intel-avx siwave/2023R2
WRF/4.1.2-intel (D) sixplore/2023R2
abaqus/2022 subread/2.0.3
admixture/1.3.0 sutility/2023R2
amber/18 thermo_pw/1.1.1
ansa/v19.1.1 turbomole/7.5
ansa/v19.1.2 turbomole/7.6
ansa/v21.0.0 turbomole/7.7 (D)
ansa/v22.1.2 vmd/1.9.4
ansa/v23.1.0 xcrysden/1.6.2
ansa/v24.0.1 (D) ximmer/9d165ea
ansys/2019R1 xtb/6.3.3
ansys/2019R3 (D)
------------------------- /mnt/apps/custom/modulefiles -------------------------
DL_MESO/2019 intel/2021.5.0-12.2.0
Garfield++/4.0 ioapi/3.2-20200828
MESA/r15140 (D) jblas/v1.2.4
NUPACK/4.0.0.23 (D) lammps/23jun2022-allegro-rome
OpenCilk/v2.0 lammps/20200505-gcc-vtk
ProDiMo/devel lammps/20200505-intel
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2 lammps/20220107-gcc-nequip
STEMsalabim/5.0.0-mvapich2.3.3 lammps/20220517-gcc-nequip
ambertools/22 lammps/20220623-ampere (D)
castep/19.11 libradtran/2.0.4
castep/20.11 (D) lositan/4ed774c
centos8 morphographx/2.0
crystal17/v1.0.2 openblas/v0.3.24
ecaccess-webtoolkit/6.3.1 oq-engine/3.13.0
einstein-toolkit/Kowalevski platanus/v1.2.4
gffcompare/ebef7e0 xflr5/6.56
-------------------- /usr/share/lmod/lmod/modulefiles/Core ---------------------
lmod settarg
Where:
D: Default Module
L: Module is loaded
If the avail list is too long consider trying:
"module --default avail" or "ml -d av" to just list the default modules.
"module overview" or "ml ov" to display the number of modules for each name.
Use "module spider" to find all possible modules and extensions.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching
any of the "keys".
Εισαγωγή στη χρήση modulefiles¶
Τα λογισμικά/εφαρμογές γίνονται διαθέσιμα με τη χρήση modulefiles. Για παράδειγμα όταν κάνουμε login στη συστοιχία η έκδοση του gcc compiler (μεταγλωττιστή) που είναι διαθέσιμη είναι η 4.8.5:
# gcc --version
gcc (GCC) 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-36)
Copyright (C) 2015 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions. There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
Η έκδοση αυτή ονομάζεται "έκδοση συστήματος".
Για να κάνουμε διαθέσιμη στο περιβάλλον χρήσης (στη γραμμή εντολών) μία άλλη έκδοση θα πρέπει να φορτώσουμε πρώτα το αντίστοιχο modulefile, π.χ. για να χρησιμοποιήσουμε την έκδοση 9.2.0:
# module load gcc/9.2.0
# gcc --version
gcc (Spack GCC) 9.2.0
Copyright (C) 2019 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions. There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
Παρατηρούμε στην έξοδο της gcc --version ότι η έκδοση είναι η 9.2.0 και όχι αυτή του συστήματος (4.8.5). Αν θέλουμε να δούμε ποιές εκδόσεις του πακέτου/λογισμικού gcc είναι διαθέσιμες θα πρέπει να τρέξουμε την εντολή module avail gcc, π.χ.:
# module avail gcc
------------ /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/Core -------------
gcc/5.5.0 gcc/6.4.0 gcc/7.3.0 gcc/8.2.0 (D) gcc/9.2.0
Where:
D: Default Module
Use "module spider" to find all possible modules.
Use "module keyword key1 key2 ..." to search for all possible modules matching any of the
"keys".
Στην έξοδο της τελευταίας εντολής παρατηρούμε ότι η default έκδοση είναι η 8.2.0, άρα αν καλέσουμε module load gcc χωρίς να καθορίσουμε κάποια συγκεκριμένη έκδοση θα ενεργοποιηθεί η έκδοση 8.2.0 όπως φαίνεται και στο παρακάτω πλαίσιο:
# module load gcc
# gcc --version
gcc (GCC) 8.2.0
Copyright (C) 2018 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions. There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
Δομή modulefiles¶
Τα περισσότερα πακέτα λογισμικού που είναι κεντρικά εγκατεστημένα στη συστοιχία έχουν γίνει compile με έναν ή περισσότερους compilers (π.χ. με gcc και με intel). Ομοίως (και ένα επίπεδο παρακάτω) μία παράλληλη εφαρμογή μπορεί να έχει γίνει compile χρησιμοποιώντας περισσότερες από μία mpi υλοποιήσεις (π.χ. και με openmpi και με intel-mpi).
Κατα συνέπεια η δομή των modulefiles που είναι διαθέσιμα είναι ιεραρχική, δηλαδή οι βιβλιοθήκες ή εφαρμογές που έχουν γίνει compile με ένα συγκεκριμένο compiler φαίνονται ως διαθέσιμες με την module avail μόνο αφότου έχουμε φορτώσει στο περιβάλλον το δεδομένο compiler.
Στο πρώτο επίπεδο της ιεραρχίας βρίσκονται οι compilers. Κατόπιν login είναι τα μόνα λογισμικά διαθέσιμα προς χρήση:
# module avail
----- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/Core ------
gcc/5.5.0 gcc/10.2.0
gcc/6.4.0 intel-oneapi-compilers/2022.0.2-sygdcrc
gcc/7.3.0 intel/19.0.5 (D)
gcc/8.2.0 (D) intel/20.0.2
gcc/9.2.0
gcc/9.4.0-eewq4j6
Στο δεύτερο επίπεδο βρίσκονται οι περισσότερες εφαρμογές. Για να τις δούμε ως διαθέσιμα modulefiles θα πρέπει πρώτα να φορτώσουμε ένα compiler, π.χ.:
# module load intel/19.0.5
# module avail
- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/intel/19.0.5 --
autoconf/2.69 hwloc/1.11.9 openmpi/3.1.2
automake/1.16.1 hwloc/1.11.11 (D) openmpi/3.1.3
axel/2.16.1 jasper/1.900.1 openmpi/3.1.4 (D)
bison/3.4.2 libjpeg-turbo/1.5.90 openssl/1.0.2o
boost/1.70.0 libpng/1.6.34 openssl/1.1.1d (D)
bzip2/1.0.8 libpng/1.6.37 (D) perl/5.26.2
cgal/4.13 libtool/2.4.6 perl/5.30.0 (D)
cmake/3.9.6 libxml2/2.9.8 pkgconf/1.4.2
cmake/3.12.3 libxml2/2.9.9 (D) pkgconf/1.6.3 (D)
cmake/3.15.4 (D) m4/1.4.18 python/3.3.5
curl/7.63.0 miniconda2/4.5.11 readline/7.0
diffutils/3.6 miniconda3/4.5.11 readline/8.0 (D)
diffutils/3.7 (D) mpfr/4.0.2 slurm/17-11-8-1
expat/2.2.9 nasm/2.13.03 sqlite/3.30.1
fontsproto/2.1.3 ncurses/6.1 tar/1.32
gmake/4.2.1 numactl/2.0.11 xz/5.2.4
gmp/6.1.2 numactl/2.0.12 (D) zlib/1.2.11
help2man/1.47.11 openblas/0.3.7
----- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/Core ------
gcc/5.5.0 gcc/10.2.0
gcc/6.4.0 intel-oneapi-compilers/2022.0.2-sygdcrc
gcc/7.3.0 intel/19.0.5 (D)
gcc/8.2.0 (D) intel/20.0.2
gcc/9.2.0
gcc/9.4.0-eewq4j6
Κάποιες εφαρμογές που είναι παράλληλες (αξιοποιούν τη χρήση μίας mpi βιβλιοθήκης) βρίσκονται σε τρίτο επίπεδο, π.χ. οι βιλβιοθήκες hdf5:
# module load openmpi/3.1.3
# module avail
------ /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/openmpi/3.1.3-q4h4qu4/intel/19.0.5.281 -------
hdf5/1.8.19 hdf5/1.10.4 (D) netcdf-fortran/4.4.4 netcdf/4.6.1 regcm/4.4.5.11 regcm/4.7.0 (D)
------------------- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/intel/19.0.5 --------------------
autoconf/2.69 fontsproto/2.1.3 miniconda2/4.5.11 perl/5.30.0 (D)
automake/1.16.1 gmake/4.2.1 miniconda3/4.5.11 pkgconf/1.4.2
axel/2.16.1 gmp/6.1.2 mpfr/4.0.2 pkgconf/1.6.3 (D)
bison/3.4.2 help2man/1.47.11 nasm/2.13.03 python/3.3.5
boost/1.70.0 hwloc/1.11.9 ncurses/6.1 readline/7.0
bzip2/1.0.8 hwloc/1.11.11 (D) numactl/2.0.11 readline/8.0 (D)
cgal/4.13 jasper/1.900.1 numactl/2.0.12 (D) slurm/17-11-8-1
cmake/3.9.6 libjpeg-turbo/1.5.90 openblas/0.3.7 sqlite/3.30.1
cmake/3.12.3 libpng/1.6.34 openmpi/3.1.2 tar/1.32
cmake/3.15.4 (D) libpng/1.6.37 (D) openmpi/3.1.3 (L) xz/5.2.4
curl/7.63.0 libtool/2.4.6 openmpi/3.1.4 (D) zlib/1.2.11
diffutils/3.6 libxml2/2.9.8 openssl/1.0.2o
diffutils/3.7 (D) libxml2/2.9.9 (D) openssl/1.1.1d (D)
expat/2.2.9 m4/1.4.18 perl/5.26.2
----------------------- /mnt/apps/aristotle/site/share/spack/lmod/linux-centos7-x86_64/Core ------------------------
gcc/5.5.0 gcc/6.4.0 gcc/7.3.0 gcc/8.2.0 (D) gcc/9.2.0 intel/19.0.5 (L)
Χρήση spider¶
Για να δούμε ποιά modulefiles θα χρειαστεί πρώτα να φορτώσουμε προκειμένου να κάνουμε μία εφαρμογή διαθέσιμη στο περιβάλλον χρήσης μπορούμε να χρησιμοποιούμε την module spider. Π.χ. για να δούμε ποιές επιλογές έχουμε διαθέσιμες για να "φορτώσουμε" την βιβλιοθήκη fftw (Fastest Fourier Transform in the West) μπορούμε να εκτελέσουμε την εξής εντολή:
# module spider fftw/3.3.8
-------------------------------------------------------------------------------------------
fftw: fftw/3.3.8
-------------------------------------------------------------------------------------------
You will need to load all module(s) on any one of the lines below before the "fftw/3.3.8" m
odule is available to load.
gcc/6.4.0 openmpi/3.1.3
gcc/7.3.0 openmpi/3.1.3
gcc/8.2.0 openmpi/3.1.3
gcc/9.2.0 openmpi/3.1.4
Help:
FFTW is a C subroutine library for computing the discrete Fourier
transform (DFT) in one or more dimensions, of arbitrary input size, and
of both real and complex data (as well as of even/odd data, i.e. the
discrete cosine/sine transforms or DCT/DST). We believe that FFTW, which
is free software, should become the FFT library of choice for most
applications.
Βλέπουμε ότι η συγκερκιμένη βιβλιοθήκη (fftw/3.3.8) υπάρχει τέσσερις φορές εγκατεστημένη και για να την φέρουμε στο περιβάλλον χρήσης θα πρέπει να φορτώσουμε πρώτα ένα συνδυασμό του gcc και του openmpi, π.χ.:
# module load gcc/9.2.0 openmpi/3.1.4
# module load fftw/3.3.8
τελευταία ενημέρωση:
November 28, 2023